Staraniem czeklisty jest ustalenia nazw głównych, wskazania synonimów; często podane są też oficjalne nazwy polskie, informacje o występowaniu na danym terenie i/lub publikacje na temat.
Jak każda kodyfikacja, czeklista starzeje się. Jest to skutkiem zmian w taksonomii: opisywanie nowych taksonów, łączenie lub podział istniejących, ustalanie priorytetu nazw i dość częste wśród grzybów przesunięcia gatunków pomiędzy rodzajami lub tworzenie nowych.
Nomenklatura przyjęta w grzyby.pl stara się trzymać aktualnych polskich czeklist. W wielu wypadkach ruch w systematyce jest tak istotny, że nie jest to możliwe. Tak więc ze źródeł pierwotnych, dla ustalenia nazwy głównej w nagłówku strony użyte są: dla grzybów podstawkowych Wojewoda W., 2003 — Checklist of polish larger basidiomycetes. [105], dla grzybów workowych Chmiel, M.A., 2006 — Krytyczna lista wielkoowocnikowych grzybów workowych Polski. Checklist of Polish larger Ascomycetes. [140], dla porostów Fałtynowicz, W, 2003 — The lichens, lichenicolous and allied fungi of Poland. An annotated checklist [153] lub Fałtynowicz, W., Kossowska, M., 2016 — The lichens of Poland. A fourth checklist. [153.4].
W większości przypadków za nazwę główną w nagłówku strony przyjmowana jest ta podana w bazie mycobank.org. Jeśli jest ona różna od nazwy głównej w polskich czeklistach, to może się pojawić stosowna adnotacja przy polskiej nazwie głównej umieszczonej wśród synonimów. W niektórych, bardziej złożonych przypadkach, w polu tytułu strony, pod nazwami jest podany krótki komentarz nomenklatoryczny. Zaletą Mycobank jest większa liczba synonimizacji i przeważnie szybkie nadążanie za postępem badań.
Czasem nazwą główną jest ta używana w GBIF. Zdaje się, że przyjęty tam system jest przeważnie nieco bardziej konserwatywny niż Mycobank i bliski brytyjskiemu ujęciu czeklistowemu. Użycie danych z GBIF jest motywowane praktyczną stroną, wynikającą z przekazywania danych GREJ do tej bazy przez Polskie Towarzystwo Mykologiczne.
Żadna czeklista nie jest doskonała w całości. Wszystkie mają mocniejsze i słabsze miejsca dla różnych grup gatunków grzybów. Należy jeszcze wspomnieć o wartościowym źródle - Indeks Fungorum. Wszystkie wymienione nie wymienionej wyżej i inne czeklisty dostępne w Internecie wzajemnie korzystają ze swoich zasobów i mają swoje osobliwości. Ich wartość może zmienić się w czasie. Przy przeglądzie nomenklatury wszystkich taksonów ujętych w grzyby.pl, wykonanym na przełomie 2022/23, korzystałem głównie z Mycobank, GBIF i Wojewoda W., 2003 — Checklist of polish larger basidiomycetes. [105] (kolejność oddaje wagę), bazując na wcześniejszej (1997-2022) pracy opartej głównie na Index Fungorum, Wojewoda W., 2003 [105] i Mycobank.